E6與摩托之前推出的E680在硬件方面基本相同，采用了采用了英特爾XScale312MHz的CPU，延續摩托經典的Linux系統，同樣支持手寫。但是作為智能手機，該機可沒有E680那么憨態可掬，完全是商務手機的外形，該機采用合金金材質，沉穩黑色外衣，摒棄E680的肥碩造型走的是輕薄路線，三圍為111x51.5x14.5mm，重121克，雖然厚度不能與V3系列相媲美，但是在智能手機里面也絕對是比較薄的了。而且經過了細膩的磨砂處理的機身，更能對抗指紋和油污。

　　該機的屏幕方面，E6采用了26萬色TFT彩色屏幕，分辨率達到了240×320像素，加上2.4英寸的尺寸，屏幕的色彩還原很不錯。值得一提的是，該機不同于以前的PDA手機，采用了全新Touchscreen屏幕觸控技術，Touchscreen的屏幕觸控技術令E6的機身正面處于一個水平面，不像以往具備手寫輸入的手機一般向內凹陷，而且觸控感應也很快，手寫輸入時，識別率很高。

　　該機采用40和弦鈴聲，支持MIDI、MP3、WAV、AMR、WMA、AAC+等多種格式。內置Realone播放器播放，同樣支持多種音頻格式，支持后臺和全屏播放，同時還內置FM調頻收音機，而且作為音樂手機該機還支持立體聲耳機和藍牙耳機。