酷派9900在系統(tǒng)方面也進(jìn)行了升級(jí)，采用的是酷派自主研發(fā)的智囊4.0操作系統(tǒng)，它是基于Android系統(tǒng)開發(fā)的，全新的智囊4.0在界面和功能上進(jìn)行了非常深入的升級(jí)，例如桌面增加了CoolRouter（資訊推送）和CoolFans（社交網(wǎng)絡(luò)）插件。

　
酷派9900的界面

實(shí)際操控方面，由于酷派9900采用的是性能強(qiáng)勁的1.5GHz雙核處理器，所以在系統(tǒng)運(yùn)行上比較占優(yōu)勢(shì)，而且寬大的5英寸屏幕可以讓我們方便的使用手指進(jìn)行操作，雖然分辨率較高，但是對(duì)于酷派9900的雙核處理器來說毫無壓力，在界面的滑動(dòng)時(shí)完全沒有延遲，與目前主流的雙核旗艦手機(jī)保持在一個(gè)水平。

　
酷派9900的界面

　
酷派9900的界面