酷派9900手機采用的是5英寸的夏普ASV屏幕，分辨率為960×640像素，達到了目前次頂級水準（遺憾不是HD屏幕），顯示效果出色。值得一提的是，酷派9900為了照顧對續航要求較高的商務人士，采用了非常人性化的雙類型電池設計，它可以安裝一塊薄電（1800毫安時）或者一塊厚電（2650毫安時），在使用厚電時，機身背部會有一定的增厚，如果使用薄電，酷派9900的機身最薄處達到了9.9毫米。
酷派最重要的提升就是采用了高端旗艦手機主流的雙核處理器，而它采用的是目前全球已上市運行頻率最高的1.5GHz雙核，為高通的MSM8660處理器。內存方面，酷派9900擁有768MB RAM（運行內存）和1GB ROM，還擁有16GB的大容量存儲空間，支持Micro SD擴展。酷派9900在系統方面也進行了升級，采用的是酷派自主研發的智囊4.0操作系統，它是基于Android系統開發的，全新的智囊4.0在界面和功能上進行了非常深入的升級，例如桌面增加了CoolRouter（資訊推送）和CoolFans（社交網絡）插件。
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